Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl8P62918 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl8P62918 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms