Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl31P62900 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl31P62900 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms