Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ElobP62869 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ElobP62869 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ElobP62869 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ElobP62869 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ElobP62869 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ElobP62869 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ElobP62869 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ElobP62869 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ElobP62869 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ElobP62869 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ElobP62869 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms