Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23aP62751 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms