Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmo4P61969 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms