Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms