Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vbp1P61759 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms