Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme3P61290 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme3P61290 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme3P61290 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms