Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snap25P60879 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snap25P60879 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snap25P60879 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap25P60879 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms