Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ActbP60710 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ActbP60710 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ActbP60710 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ActbP60710 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ActbP60710 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ActbP60710 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms