Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmtd1P59913 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd1P59913 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms