Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdrg1P59048 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms