Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm6sf1P58749 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm6sf1P58749 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tm6sf1P58749 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tm6sf1P58749 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms