Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dpf3P58269 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms