Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrpa1P57784 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms