Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpaP53566 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpaP53566 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpaP53566 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpaP53566 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpaP53566 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CebpaP53566 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CebpaP53566 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpaP53566 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms