Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efnb1P52795 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms