Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms