Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1cP52432 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1cP52432 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms