Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClgnP52194 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms