Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XpcP51612 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XpcP51612 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XpcP51612 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XpcP51612 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XpcP51612 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XpcP51612 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XpcP51612 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XpcP51612 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XpcP51612 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XpcP51612 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XpcP51612 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XpcP51612 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XpcP51612 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XpcP51612 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms