Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CastP51125 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CastP51125 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CastP51125 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CastP51125 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CastP51125 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CastP51125 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CastP51125 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CastP51125 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CastP51125 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CastP51125 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CastP51125 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CastP51125 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CastP51125 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CastP51125 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CastP51125 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CastP51125 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CastP51125 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CastP51125 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CastP51125 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CastP51125 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CastP51125 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CastP51125 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.3 ms