Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SftpdP50404 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms