Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms