Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx3P48759 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptx3P48759 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms