Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms