Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl11P48298 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl11P48298 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms