Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax7P47239 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms