Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ItgavP43406 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgavP43406 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ItgavP43406 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgavP43406 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms