Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad52P43352 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad52P43352 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad52P43352 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms