Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec3bP43025 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec3bP43025 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms