Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms