Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tac1P41539 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac1P41539 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms