Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt4P40749 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt4P40749 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt4P40749 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms