Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VhlP40338 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VhlP40338 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VhlP40338 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VhlP40338 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VhlP40338 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VhlP40338 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms