Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csf3rP40223 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms