Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms