Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grik2P39087 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik2P39087 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik2P39087 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik2P39087 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms