Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprkP35822 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprkP35822 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprkP35822 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprkP35822 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprkP35822 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprkP35822 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprkP35822 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprkP35822 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprkP35822 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprkP35822 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms