Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms