Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab17P35292 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab17P35292 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms