Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms