Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar1P33896 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms