Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif4P33174 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif4P33174 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif4P33174 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms