Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms