Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms