Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fkbp4P30416 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fkbp4P30416 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms