Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VtnP29788 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VtnP29788 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VtnP29788 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VtnP29788 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VtnP29788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VtnP29788 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VtnP29788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VtnP29788 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VtnP29788 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms