Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtgfP29268 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtgfP29268 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms