Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NapbP28663 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NapbP28663 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NapbP28663 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NapbP28663 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NapbP28663 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NapbP28663 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NapbP28663 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NapbP28663 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NapbP28663 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NapbP28663 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NapbP28663 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NapbP28663 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NapbP28663 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NapbP28663 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NapbP28663 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NapbP28663 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NapbP28663 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms